Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC85CA6NKD9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms