Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GOLGA6BA6NDN3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms