Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PRAMEF22A3QJZ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRAMEF22A3QJZ6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms