Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSC5DA1L4H1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC5DA1L4H1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms