Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
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