Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
V9GY48 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
V9GY48 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
V9GY48 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
V9GY48 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
V9GY48 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
V9GY48 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
V9GY48 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
V9GY48 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms