Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC1Q9Y5R8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms