Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HDGFL3Q9Y3E1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms