Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y1

POLR3K, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3KQ9Y2Y1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLR3KQ9Y2Y1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
POLR3KQ9Y2Y1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms