Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
DTX4Q9Y2E6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms