Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RCE1Q9Y256 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RCE1Q9Y256 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms