Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPC6Q9Y210 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRPC6Q9Y210 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms