Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SORCS3Q9UPU3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SORCS3Q9UPU3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms