Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF8Q9UPP1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF8Q9UPP1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms