Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW3

ABT1, Activator of basal transcription 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABT1Q9ULW3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABT1Q9ULW3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ABT1Q9ULW3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms