Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNRF3Q9ULT6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNRF3Q9ULT6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms