Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMCC3Q9ULS5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms