Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PNMA8BQ9ULN7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PNMA8BQ9ULN7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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