Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
INO80Q9ULG1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
INO80Q9ULG1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms