Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MRTO4Q9UKD2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms