Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNMT3LQ9UJW3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DNMT3LQ9UJW3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms