Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SALL4Q9UJQ4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL4Q9UJQ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms