Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAX2Q9UIW0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAX2Q9UIW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms