Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CPA4Q9UI42 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CPA4Q9UI42 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms