Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SCN11AQ9UI33 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCN11AQ9UI33 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCN11AQ9UI33 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms