Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP25Q9UHP3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms