Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CLN8Q9UBY8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLN8Q9UBY8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms