Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDE1Q9NZC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDE1Q9NZC3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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