Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PODXL2Q9NZ53 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PODXL2Q9NZ53 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms