Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GGA3Q9NZ52 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GGA3Q9NZ52 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms