Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZDHHC3Q9NYG2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms