Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDX43Q9NXZ2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDX43Q9NXZ2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms