Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COMMD8Q9NX08 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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