Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
PDS5BQ9NTI5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.3
PDS5BQ9NTI5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PDS5BQ9NTI5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms