Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LTBP3Q9NS15 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LTBP3Q9NS15 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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