Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HELLSQ9NRZ9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HELLSQ9NRZ9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms