Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DUOX2Q9NRD8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DUOX2Q9NRD8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms