Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FZD3Q9NPG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FZD3Q9NPG1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms