Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGRNQ9NPE2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGRNQ9NPE2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms