Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAB9BQ9NP90 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB9BQ9NP90 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms