Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUFT1Q9NNX1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUFT1Q9NNX1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms