Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CENPJQ9HC77 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CENPJQ9HC77 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms