Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCSER2Q9H7U1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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