Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRDM12Q9H4Q4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms