Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RIBC2Q9H4K1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RIBC2Q9H4K1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms