Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms