Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC113Q9H0I3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC113Q9H0I3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC113Q9H0I3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms