Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZNF541Q9H0D2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF541Q9H0D2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms