Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF3Q9H094 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NBPF3Q9H094 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms