Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EDEM3Q9BZQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDEM3Q9BZQ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms